Εξ αρχής συνεργαστήκαμε στενά με τις κεντρικές και τοπικές αρχές, και κυρίως με το Υπουργείο Περιβάλλοντος και Ενέργειας, το Υπουργείο Απασχόλησης και Κοινωνικής Προστασίας, τους Δήμους Κεφαλληνίας και Ζακύνθου (πρώην Νομαρχίες) και όλους τους πρώην Δήμους των νομών και τις εκάστοτε αρμόδιες αρχές όπως τις Αναπτυξιακές Εταιρείες, Εποπτείες Αλιείας, Τοπικές Ενώσεις Δήμων και Κοινοτήτων, Διευθύνσεις Πρωτοβάθμιας και Δευτεροβάθμιας Εκπαίδευσης, Λιμενικό Σώμα, το Εθνικό Θαλάσσιο Πάρκο Ζακύνθου, κτλ.
Συνεργαστήκαμε με τα Πανεπιστήμια Αθηνών, Πειραιώς, Θεσσαλίας, Μονάχου, Portsmouth και Βενετίας, με το Γεωπονικό Πανεπιστήμιο Αθηνών και με διάφορα ερευνητικά ιδρύματα όπως το Ελληνικό Κέντρο Θαλάσσιων Ερευνών, το Ελληνικό Κέντρο Βιοτόπων-Υγροτόπων, το Ινστιτούτο Helmholtz Μονάχου για την Περιβαλλοντική Υγεία και το Ινστιτούτο Θαλάσσιας Βιολογίας του Μαυροβουνίου.